2004年，姚期智离开普林斯顿大学回到中国，在清华大学担任教授。当时姚期智回国的目的就是要推动中国计算机科学的发展。他认为，最具有成效的一个方法就是培养计算机科学领域的精英人才。
这是一项非常艰难的工作。
众所周知，中国有一些特殊的优势，如出色的学生、飞速发展的经济、有效的组织性等。4年前，姚期智就问自己：“怎么利用这些优势在中国培养精英人才？”
从一开始，姚期智的目标就非常明确——在计算机科学领域，为最聪明的中国学生创造学习、研究的良好环境，以对他们将来的发展有所帮助。
在全球化时代，人才的竞争是非常激烈的。大部分计算机、信息领域的高材生毕业之后都想去美国进一步深入学习。是否有办法可以保留一部分高材生，让他们在中国继续他们的教育，促进中国计算机、信息科学的发展，这就是姚期智考虑的问题。
“只从表面做工作是不够的，需要建立起一个系统的培养方案，可以给中国的高材生提供一个合理的选择，使他们觉得留在国内并不会牺牲自己的前途。”姚期智说。
实际操作起来并不容易。姚期智说：“因为只有当学生真正相信我们提供的条件与发达国家能够媲美时，他们才会留下来。同时，还必须获得政府和其他机构的资金支持，才能开展系统的培养方案。”
姚期智正在开展的教育方案包括一个本科生的精英课程。姚期智介绍，精英课程每年从清华大学计算机科学系的大一学生中录取30个学生，给他们制订10个专门的课程，包括计算机理论科学和计算机系统领域。
“当然仅仅教授课程是不够的，必须有一个研究环境来支持我们的培养工作。”于是在2006年，姚期智在清华大学成立了计算机理论科学研究院，开始了研究生的培养方案。
姚期智介绍，研究生的培养着重在计算机理论科学方面，这非常需要国际合作交流。因此学生至少有一年公费出国深造的机会。“有了足够的国际交流互动，这些具有天赋的中国学生，会加倍努力使自己跟国外的对手一样棒。”
为了增强研究生培养的师资力量，姚期智建立了一个强有力的教研团队，目前包括博士后团队以及知名研究人员组成的导师组。
“教育项目越早起步越好。”姚期智表示：“所以，如果有学生愿意在中国做研究生项目，我们就会在本科阶段先安排一些项目给他们，这样就使得他们能够融入之后的研究生学习氛围。”
为了研究生有更多的国际交流机会，姚期智还启动了一些具有创新性的模式，其中有一个全都是由学生参加的国际研讨会。会议邀请国外高校毕业不久但已经做出杰出工作的学生，与国内的学生讨论交流。
姚期智强调：“在当今中国，只要抓住各种资源带给我们的机会、为学生创造良好的环境、打破学科之间的边界、建立有效的激励机制，就很有可能培养出科学精英人才。”
